PDB文件全称为蛋白质数据银行文件（Protein Data Bank file），是存储蛋白质结构的标准格式之一。通俗来说，PDB文件相当于是一份蛋白质的“全貌图”，记录着蛋白质结构的三维坐标信息和相关性质。

PDB文件的主要作用是用来描述和展现蛋白质结构的。对于蛋白质科学研究来说，PDB文件具有非常重要的意义。在研究一种未知蛋白质的功能及其相应结构时，研究人员可以通过分析已经解析的蛋白质结构来推断这种未知蛋白质的可能结构和功能。这个过程中，需要依赖大量的蛋白质结构数据库，其中PDB数据库就是蛋白质结构数据领域的权威之一。

在理解PDB文件的作用之前，需要先了解蛋白质结构的概念。蛋白质结构是指蛋白质分子中各个原子的空间位置和相互作用的方式。也就是说，它主要是由该蛋白质分子的氨基酸序列所构建出的三维空间结构。这个三维结构决定了蛋白质在体内的功能和特性，也影响着与其相互作用的其他分子的行为。

PDB文件一般是通过X-射线晶体学或核磁共振等现代化技术得到的。在获得蛋白质的结构后，科学家们需要将其转换为PDB文件，以便存储和共享。一个完整的PDB文件通常包含与蛋白质相关的所有信息，如氨基酸序列、原子坐标信息、结构域定义、键结构、拓扑结构等等。对于分析蛋白质的结构和功能来说，这些信息非常重要。

值得一提的是，PDB文件不仅可以用于蛋白质结构的储存和共享，也可以被用来进行各种生物医学研究。例如，科学家们可以通过对一些PDB文件的比较和分析，来研究不同蛋白质之间的结构和功能之间的关系，或者寻找某个结构域的蛋白质在其他生物体系中的对应物等。此外，基于PDB的蛋白质工程和药物开发研究也正在成为一个新的研究领域。

总之，PDB文件是蛋白质科学研究领域中极为重要的一种数据类型，它的使用不仅可以增加研究效率，也可以为科学家们提供更加准确和全面的蛋白质结构信息。在未来，随着科技的发展和应用的深入，PDB文件仍将发挥越来越重要的作用，成为更多生物医学领域的重要数据源。